La nisina es altamente efectiva para controlar las bacterias del ácido láctico (LAB) durante la fermentación y no tiene impacto en la actividad de las bacterias fermentadoras en la mayoría de los procesos de fermentación de biocombustibles convencionales. Al pasar de la conservación de alimentos a la fermentación industrial, la industria del etanol combustible considera ampliamente a la nisina como una de las alternativas más ideales a los antibióticos tradicionales como la penicilina y la virginiamicina.